分子生物学二次数据库资源平台的构建
Construction of Molecular Biology Secondary Database Resources Platform
作者: 杨 勇 , 杜 晶 , 曹兴芹 ：新疆师范大学，计算机科学技术学院，乌鲁木齐;
关键词: 生物信息学； 分子生物二次数据库； BioPerl； MVC模型； Bioinformatics； Molecular Biology Secondary Database； BioPerl； MVC Model
摘要:Abstract: In bioinformatics, bio-secondary databases can build more in-depth study of specific species. Re-sponse to the urgent need to build a platform for molecular biology secondary database resources, molecular biology secondary database was constructed by using biosql, using tomcat 6.0 + Myec-lipse + mysql technology, MVC development model, in order to achieve a gene as an example of re-silience web resource database platform. The establishment of the secondary database of molecular biology and the automatic acquisition of the stress resistance genetic data can be solved by this platform. The platform can timely accept the data upload and the fast retrieval of stress resistance genes from researchers. It can also be applied to other types of molecular biology, accelerates re-search on a range of molecular biology and makes the research more targeted.
文章引用: 杨 勇 , 杜 晶 , 曹兴芹 (2014) 分子生物学二次数据库资源平台的构建。 计算机科学与应用， 4， 323-332. doi: 10.12677/CSA.2014.412044
参考文献
[1] 晏瑾, 肖浪涛 (2006) 农业生物信息数据库发展现状及应用. 生物技术通讯, 4, 23-27.
[2] 邢仲璟, 林丕源, 林毅申 (2004) 基于BioPerl的生物二次数据库建立及应用. 计算机系统应用, 11, 58-60.
[3] 周猛, 童春发, 施季森 (2008) 充分利用BioPerl加速生物信息学的研究. 生物信息学, 1, 43-45.
[4] 白琳 (2012) 植物抗逆基因资源平台的构建与分析. 硕士论文, 浙江大学, 杭州.
[5] BioPerl.Installation. http://www.BioPerl.org/wiki/Installing_BioPerl
[6] 孙啸, 陆祖宏, 谢建明 (2005) 生物信息学基础.清华大学出版社, 北京.
[7] 向福, 陈悟, 余龙江 (2004) 基于BioPerl的基因序列获取的程序设计与实现. 生物技术, 6, 64-66.
[8] biosql操作指南. http://www.biosql.org/wiki/Main_Page
[9] 郭文久 (2007) Perl语言环境下生物信息学的数据库技术. 安康学院学报, 5, 74-78.
[10] 贾广宇 (2006) MVC设计模式下Web开发框架的研究与应用. 大连海事大学, 大连.
[11] 宋利军 (2003) RedHat Linux 9.0 实用教程. 科学出版社, 北京, 121-122.
[12] 万跃华, 何立民 (2002) 生物信息学数据库资源建设. 现代图书情报技术, 2, 12-16.